我国水利工程生态环境效应研究还处于探索阶段，必须科学、合理地分析和评价水利工程对生态环境产生的正负效应，促进人类社会和自然环境健康和谐地发展。建立统一的评价标准、改进评价方法和扩大水利工程生态环境效应研究尺度等问题有待进一步研究。
一、水利工程生态环境效应的内涵
明确水利工程生态环境效应的内涵是进行生态环境效应评价的前提，其重要性体现在评价内容的涵盖范围、评价指标的恰当选取、指标体系的建立等全过程，关乎最终评价结果的可靠性。从普遍意义上讲，水利工程的生态环境效应是指水利工程的兴建对生态环境系统产生的影响。
一般认为，水利工程的生态环境效应是指工程建设及运行对河流生态环境系统结构和功能的各种影响。把生态环境效应归纳为水利工程建成后对自然界的生态破坏和生态修复两种效应的综合结果。水电工程的生态环境效应分析建立在生态基础之上的，并对人类、自然、野生动植物等受到的影响进行了综合分析，而对经济效益和社会效益不作评价。国外对于水利工程环境影响评价及效应评价没有特意做出区分，前者是指在方案实施前，预测其对环境系统可能的影响，有严格的评估规范和操作步骤，而后者则指水利工程在建设期和运行期对生态环境系统产生的重大、局部的影响，如沉积扰动、径流减少、水质恶化、水生生态系统和河岸生态系统的破坏等。
把握好水利工程生态环境效应的内涵应重视以下3个方面：首先是生态环境效应的时间尺度，不能仅考虑工程建成后的生态环境效应，还要着眼于水利工程规划·设计、建造、运行的整个过程。其次是生态环境效应的空间尺度，不能局限于河流生态环境系统，还包括陆地生态环境系统、人类生活生产系统，考虑对自然界的综合结果。最后是生态环境效应的全面性，除了考虑工程建设期和运行期所产生的负面效应，也要考虑其正面效应，包括其对生态环境系统的修复作用，对人类社会的经济效益和社会效益。
二、水利工程生态环境效应的评价体系
水利工程生态环境效应是一个涉及生态、环境、社会、经济的复杂大系统，需要客观、全面地分析水利工程对当地生态环境和社会经济的影响。水利工程生态效应评价不同于工程建设前的环境影响评价，与水电工程评估也不同，它是针对已建成的水利工程，从人居环境影响、野生动植物影响、自然规律影响、经济发展影响等4个方面进行综合分析。水利工程生态环境效应评价体系主要由评价指标体系、评价标准和评价方法构成。
三、相关学科的形成和发展
传统的水利工程是通过建设水工建筑物来达到改造和控制河流的目的，满足人们生产生活的多种需求。近20年来，在大力发展水利工程的同时，人们逐渐意识到水利工程建设对生态环境的负面影响，开始注意对生态系统的保护，并在一定意义上发展了生态工程技术和建设理念。关于河川的生态工程，德国称为近自然河道治理工程，日本称为多自然型建设工法，美国称为自然河道设计技术。与此同时，许多国家推进了生态工程理论的发展，并逐渐形成了一门新的学科——生态工程学，其研究范围涵盖河流、湖泊、湿地、矿山、森林、土地及海岸等诸多方面，主旨是寻求人类社会和自然环境双方共同受益，探讨可持续生态系统的设计方法。我国水利工程生态环境效应的研究也促进了生态水工学、生态水文学、生态水力学、景观生态学等交叉学科的发展。
四、水利工程生态环境效益研究的发展趋势
（1）评价指标体系的进一步研究。在水利工程生态环境效应评价中，指标体系的建立是关键。生态环境系统的发展变化受多种因素影响，从中选择能较好地反映系统状态、能基本反映水电开发对生态环境产生的累积和叠加影响的指标因子是一个较难把握的问题。此外定量指标的收集、计算以及定性指标的合理分析、估计也是评价过程中的一大难点。未来的研究要综合考虑这些问题，力求建立一套科学合理的、具有代表性的评价指标体系。
（2）统一评价标准的建立。目前水利工程生态环境效应评价还没有统一的评价标准，这里的“统一”是指广义上的统一。由于评价对象各方面条件不同，不可能用统一标准来评价，但可以建立广义上的统一评价标准，如可以根据评价对象所处地区的不同，建立分区评价标准，同一区域内的评价对象采用相同的评价标准。评价对象规模不同，建立分级评价标准，同一级别的评价对象采用相同的评价标准。还可以根据水利工程类型不同，建立相应的评价标准等。有了这样的统一评价标准，在以后的水利工程生态环境效应评价中，不再需要评价者自行建立评价标准，使得评价结果更具有科学性和可比性。
（3）评价方法的改进。联合运用多种综合评价方法并借鉴其他学科领域的评价方法，以弥补单个评价方法的不足，使得评价结果更准确、评价过程更简单。随着计算机技术的飞速发展，大力开发智能评价技术，把专家系统、知识工程、人工神经网络等先进的人土智能技术引入到水利工程生态环境效应评价领域中，研究开发综合评价计算机软件系统，提供友好的人机交互界面，实现问题描述可视化和智能评价过程，减少人工参与，降低综合评价的工作强度及评价成本，提高评价结果的可信度。
水利水电工程监理公司表示水利工程建设在为人类带来巨大社会效益和经济效益的同时，也扰动了长期形成的生态环境系统的稳定性，因此需要科学地分析和评价水利工程与生态环境系统之间的相互作用关系，促进人类社会和自然环境合谐健康地发展。
