在南京黑臭河道整治中，给黑臭河道“动手术”，截断污染源、开展排水达标区创建，可是，就算完成了截污、清淤整治，河道如果没有活水进入，依然无法彻底消除黑臭。为此，南京市正在谋划打通全市河道的“任督二脉”——《南京主城水系连通及生态补水规划方案》已经制定完成，南京市将用3年时间，让所有的河网贯通连接，让每一条河都“活”起来。
在城市开发建设中，高楼、道路截断了河道，水面洼地消失，河流大多被地下管道所代替，或成为断面大幅度缩小的暗涵，一些河道由于缺乏连通，变得没有生机，这也是黑臭反复的“病根”所在。因此，“引流补水”是改善水环境的重要手段。在本轮消灭黑臭河道的“攻坚战”中，南京市提出了将区域河道和外域大江、大河水系贯通的治水方案。
引流补水的作用在玄武湖水质改善中已经得到证实。在玄武湖周围有不少补水口，从上元门水厂、化纤厂水厂引来的长江水，源源不断地进入玄武湖，每天补水量达到28万吨，玄武湖水质因此始终处于四类水标准，符合景观水质的要求。不过，河西新城、南部新城、仙林副城等区域的河道仍处于没有连通、没有来水的状态，要想使得河道恢复流动就必须打通水系，进行生态补水。
怎样打通水系，进行生态补水？根据《南京主城水系连通及生态补水规划方案》，在现有的补水基础上，计划完善长江、金川河、内外秦淮河以及秦淮新河这5条“水源”和黑臭河道之间的沟通，形成高效补水体系。同时，南京市正计划开挖秦淮东河，根据规划，将以这条河流为依托，贯通主城和仙林副城水系，形成南京主城、仙林副城以及秦淮东河经过的城东南地区的生态补水通道。规划方案设计了3条补水“大动脉”，即长江—玄武湖—金川河（内秦淮河）、外秦淮河—内秦淮河、秦淮新河—外秦淮河—秦淮东河。
水务局水环境处专家介绍，工程整治只是消除河道黑臭的基础，引水才是“重头戏”。明年的计划是先进行主城、河西、南部新城的河道引水工程，最终使得城北、城南、城东、河西、宁南5大片内河道都有“活水”。同时，到2019年，南京还将建成“智能引水”工程，实现远程监控、水质在线分析、自动调度控制水流等。经过整治，往日的黑臭河道唐家山沟水质已经得到明显改善，两岸绿树成荫，风景优美。
